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北京市朝阳区高新技术企业协会的最高权力机构是会员大会，由理事会召集。理事会认为必要，可以召开临时会员大会。会员大会须有2/3以上的会员出席方可召开，其决议须经到会会员半数以上表决通过方可生效。

其主要职责是：

（一）制定和修改章程；

（二）选举和罢免理事、监事；

（三）审议理事会、监事会的工作报告和财务报告；

（四）决定重大变更和终止事宜；

（五）决定其他重大事宜。